Udruga štiti i promiče prava i interese svojih članova osobito u području uređivanja uvjeta poslovanja, odnosa s tijelima državne vlasti te zakonodavstva od važnosti za cjelokupni nautički sektor. Skupština donosi Program rada koji definira buduće aktivnosti udruge i Izvršnog odbora. Udrugu nautičkog sektora zastupaju, predstavljaju i potpisuju predsjednik Izvršnog odbora, 2 dopredsjednika Izvršnog odbora te glavni direktor HUP-a.